¿cómo se produce la degradación de los aminoácidos?
¿cómo se produce la degradación de los aminoácidos? 2022
vía de degradación de los aminoácidos
El hígado es el lugar principal del metabolismo de los aminoácidos, pero también participan otros tejidos, como el riñón, el intestino delgado, los músculos y el tejido adiposo. Generalmente, el primer paso en la descomposición de los aminoácidos es la separación del grupo amino del esqueleto de carbono, normalmente mediante una reacción de transaminación. Los esqueletos de carbono resultantes de los aminoácidos desaminados se utilizan para formar glucosa o grasas, o se convierten en un intermediario metabólico que puede ser oxidado por el ciclo del ácido cítrico. Esta última alternativa, el catabolismo de los aminoácidos, es más probable que se produzca cuando los niveles de glucosa son bajos, por ejemplo, cuando una persona está en ayunas o pasa hambre.
La transaminación es un intercambio de grupos funcionales entre cualquier aminoácido (excepto lisina, prolina y treonina) y un α-cetoácido. El grupo amino suele transferirse al átomo de carbono ceto del α-cetoglutarato, convirtiendo el α-cetoácido en glutamato. Las reacciones de transaminación son catalizadas por transaminasas específicas (también llamadas aminotransferasas), que requieren el fosfato de piridoxal como coenzima.
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ResumenLa forma en que los microbios coordinan dinámicamente la captación y utilización simultánea de nutrientes en ecosistemas nutricionales complejos sigue siendo una cuestión abierta. Aquí, desarrollamos un enfoque de modelado basado en restricciones que explota los datos exo-metabolómicos no dirigidos para desentrañar los procesos de toma de decisiones adaptativas en entornos nutricionales dinámicos. De este modo, investigamos la adaptación metabólica de Escherichia coli a condiciones continuamente cambiantes durante el crecimiento por lotes en un medio complejo. Inesperadamente, el análisis basado en modelos de datos exo-metabolómicos resueltos en el tiempo reveló que el crecimiento más rápido coincide con el catabolismo preferido de aminoácidos, lo que, a su vez, reduce la captación de glucosa y aumenta el desbordamiento de acetato. Demostramos que los altos niveles intracelulares de los metabolitos de degradación de aminoácidos piruvato y oxaloacetato pueden inhibir directamente el sistema de fosfotransferasa (PTS), y revelan su papel funcional en la mediación de las decisiones reguladoras para la captación y el catabolismo de fuentes de carbono alternativas. En general, la metodología propuesta amplía el espectro de posibles aplicaciones del análisis del balance de flujos para descifrar los mecanismos de adaptación metabólica en hábitats naturales y organismos diversos.
qué es la degradación de aminoácidos
Annett Kreimeyer.Información adicionalContribuciones de los autoresAK, NF y GNC realizaron el análisis genómico y comparativo y coordinaron los procedimientos experimentales. SC realizó los experimentos de crecimiento. ST analizó la utilización de aminoácidos mediante LC-MS. NP contribuyó a los procedimientos experimentales. AL contribuyó a la elaboración de la base de datos de clostridios Anaeroscope. MG construyó la biblioteca de escopeta para la secuenciación. VB llevó a cabo el ensamblaje y el acabado del genoma. EP realizó los análisis bioinformáticos. ST, AL y VB participaron en la redacción de secciones del manuscrito. MS, DL, y JW revisado críticamente el manuscrito. GNC y JRA contribuyó a la redacción del manuscrito. AK y NF escribió el manuscrito. Todos los autores leyeron y aprobaron el manuscrito final.Material suplementario electrónico
Reprints and PermissionsAbout this articleCite this articleFonknechten, N., Chaussonnerie, S., Tricot, S. et al. Clostridium sticklandii, a specialist in amino acid degradation:revisiting its metabolism through its genome sequence.
